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InVesalius: Open Source 3D Medical Image Reconstruction Program

By admin Jan 29, 2024

¿Qué es InVesalius?

InVesalius es una reconstrucción de imágenes médicas 3D gratuita y de código abierto que genera una imagen 3D a partir de una secuencia de imágenes DICOM 2D (CT o MRI). Funciona para Windows, Linux y macOS. El proyecto está en desarrollo activo desde 2001, para satisfacer la demanda de una solución de imágenes médicas para hospitales y clínicas brasileñas.

InVesalius es un software gratuito que minimiza el coste para los usuarios finales y les proporciona funciones avanzadas que facilitan su trabajo. Se puede utilizar en la práctica médica, educación, análisis forense, veterinaria y paleontología.

InVesalius es una producción del Centro de Tecnología de la Información Renato Archer en colaboración con el Laboratorio de Biomagnetismo de la Universidad de São Paulo. Fundada en 1982 por el ministerio de ciencia de Brasil.

La interfaz del programa admite muchos idiomas (24 idiomas). Estos son algunos de los idiomas que admite: inglés, portugués, francés, español, turco, italiano, checo, japonés, catalán, coreano, rumano y alemán. También proporciona manuales para usuarios finales en inglés y portugués.

En Vesalio en acción [src:InVesalius]

La nueva versión actual es 3.1, ya que se actualiza periódicamente. Siga las nuevas funciones, las correcciones de errores y las funciones/configuraciones modificadas.

InVesalius admite muchas modalidades de imágenes médicas como tomografía computarizada, resonancia magnética y microtomografía. Sin embargo, pronto existe un plan para admitir el ultrasonido 3D.

InVesalius Navigator: un tutorial para la estimulación magnética transcraneal navegada

Reflejos

  • Código abierto con licencia GPLv2
  • Manual completo del usuario final
  • Soporta múltiples idiomas
  • Interfaz fácil de usar

En Vesalio en acción [src:InVesalius]

Características

  • Soporte DICOM que incluye (a) ACR-NEMA versión 1 y 2; (b) DICOM versión 3.0 (incluidas varias codificaciones de JPEG -sin y con pérdida-, RLE)
  • Funciones de manipulación de imágenes (zoom, panorámica, rotación, brillo/contraste, etc.)
  • Segmentación basada en cortes 2D
  • Rangos de umbral predefinidos según el tejido de interés
  • Segmentación basada en cuenca
  • Segmentación creciente de la región
  • Herramientas de edición (similares a Paint Brush) basadas en cortes 2D
  • Segmentación semiautomática basada en cuencas hidrográficas.
  • Creación de superficies 3D
  • Herramientas de conectividad de superficies 3D
  • Exportación de superficies 3D (incluidos STL binario, OBJ, VRML, Inventor)
  • Proyección de renderizado de volumen de alta calidad
  • Ajustes preestablecidos de renderizado de volumen predefinidos
  • Plano de recorte de renderizado de volumen
  • Exportación de imágenes (incluidos BMP, TIFF, JPG, PostScript, POV-Ray)
  • Proyección de intensidad mínima, máxima o media, acumulación de diferencia de intensidad máxima y visualizaciones basadas en contornos

Nuevas funciones lanzadas en la última versión (3.1)

  • Soporte para abrir archivos TIFF, BMP, JPEG y PNG (micro-CT);
  • Soporte para abrir archivos NiFTI 1;
  • Soporte para abrir archivos PAR/REC;
  • Segmentación basada en el crecimiento de la región (dinámica, umbral y confianza);
  • Selección de componentes conectados a máscaras;
  • Eliminación de componentes conectados a la máscara;
  • Herramienta para rellenar agujeros de máscara automáticamente;
  • Herramienta para rellenar agujeros de máscara de forma interactiva;
  • Herramienta para recortar máscara;
  • Soporte para mover puntos de medida de corte;
  • Opción de menú para (des)activar el modo de navegación;
  • Importe archivos de superficie (STL, PLY, OBJ y VTP) al proyecto InVesalius;
  • Información de superficie;
  • Menú de segmentación con las opciones: Umbral, Manual, Cuenca y Región de Crecimiento;
  • Creó una clase de lienzo (CanvasRendererCTX) para dibujar formas 2D y texto sobre vtkRenderer;
  • Intercambiar ejes de imagen;
  • Girar la imagen;
  • Documentación en inglés.

Formatos de imágenes médicas compatibles

InVesalius admite muchos formatos de imágenes médicas, por lo que, al igual que los formatos de imágenes fijas, admite los formatos DICOM, Analyze, PAR / REC, NIfTI, TIFF, JPG, BMP y PNG.

Tutoriales

InVesalius 3 Beta 5: segmentación de umbrales, generación de superficies y exportación STL

InVesalius 3 Beta 5 – Importación de imágenes DICOM y funciones básicas

Plataformas compatibles

  • Linux: Ubuntu, Debian, Fedora, ArchLinux.
  • Windows (32 bits, 64 bits)
  • macOS (10.11 y posteriores) 64 bits

Requisitos

Aquí hay una lista de los requisitos mínimos para ejecutar el software:

  • Procesador Intel Pentium 4 o equivalente a 1,5 GHz
  • 1 GB de RAM
  • disco duro de 80GB
  • Tarjeta gráfica de 64MB
  • Resolución de vídeo de 1024 × 768 píxeles

instalación de software

en Windows

El proyecto es compatible con Windows de 32 bits y 64 bits.

en MacOS

El proyecto ofrece a macOS una DMG (imagen de disco montada), que se puede instalar fácilmente en macOS 10.11 y posteriores.

en linux

Hay varios paquetes para (Ubuntu, Fedora y ArchLinux) y repositorios dedicados (PPA) para InVesalius para Ubuntu. Sin embargo, se puede instalar en todas las distribuciones de Linux que tengan Flatpak. Con un comando en su terminal, tendrá la aplicación en funcionamiento a tiempo. Una vez realizada la instalación, el programa puede ejecutarse a través del menú principal del sistema para (Gnome, XFCE o KDE).

Licencia

El proyecto se publica bajo la licencia pública general GNU v2.0.

Contribuir

La contribución no es solo para desarrolladores, sino también para cualquier persona que traduzca la interfaz de usuario. Para unirse al esfuerzo de traducción, debe registrarse en Transifexuna plataforma de traducción colaborativa basada en la nube, y contribuye en el idioma seleccionado.

Recursos

Nota del desarrollador

El producto final depende de muchos paquetes de software de código abierto. Utiliza Python como lenguaje de programación central y varias bibliotecas de programación que proporcionan procesamiento y análisis de imágenes, como Visualization Toolkit VTK, Grassroots DICOM GDCM, Pillow (PIL-Python Image Library Fork). )

Archivo de visores DICOM/PACS

  • Fuente abierta Visores DICOM gratuitos (Linux, Mac OSX y Windows)
  • Visores DICOM gratuitos y de código abierto para Mac OS X
  • Visores DICOM gratuitos para médicos: Windows, Linux y Mac OSX
  • Navegador de código abierto y visores DICOM basados ​​en web
  • Servicios gratuitos en línea de visores DICOM en la nube y basados ​​en la web

Etiquetas

dicom imágenes médicas Simulación médica 3D Portada de código abierto

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