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QuPath: Software gratuito y de código abierto para análisis y visualización de diapositivas completas de patología digital

By admin Jan 29, 2024

QuPath es un software de análisis de bioimagen y patología cuantitativa gratuito y de código abierto. Debido a que QuPath está construido con Java, es multiplataforma y está disponible para descargar para Windows, Mac OSX y Linux. Está diseñado para proporcionar el análisis de imágenes de portaobjetos completo necesario en patología clínica.

QuPath se desarrolla en la División de Patología de la Universidad de Edimburgo. El proyecto recibió fondos de Invest Northern Ireland y Cancer Research UK Accelerator.

Captura de pantalla de QuPath

Reflejos

  • Multiplataforma: Windows, Linux, Mac OSX
  • Ligero
  • Potente kit de visualización
  • Proporciona un análisis rápido
  • Ricas herramientas de anotación
  • Flujos de trabajo para análisis IHC y H&E
  • Nuevos algoritmos para tareas comunes, por ejemplo, segmentación celular, eliminación de arreglos de microarrays de tejidos
  • Análisis impulsado por aprendizaje automático
  • Borrar modelo de datos
  • Fácil de integrar con Matlab e ImageJ
  • Múltiples formatos para exportar
  • Soporte de tareas automatizadas
  • Análisis automatizado
  • Potente herramienta de secuencias de comandos
  • Admite el intercambio de datos con otras herramientas de código abierto como ImageJ

Captura de pantalla de QuPath

Características

  • Visor de diapositivas completas
  • Transformación de color dinámica
  • Admite archivos comprimidos y sin comprimir
  • Cuantificación de biomarcadores
  • Soporte para microarrays de tejidos
  • Identificación sofisticada de tumores
  • Minivisor
  • Múltiples opciones de visualización
  • Clasificación de objetos flexible
  • Herramientas interactivas para mostrar, hacer zoom, escalar y navegar
  • Exportaciones de imágenes
  • Análisis automatizado fácil de usar
  • Estimación de manchas
  • Analítica
  • Informes

Licencia

QuPath se publica bajo la licencia pública general GNU v3.0

Plataformas

QuPath es una plataforma multiplataforma que funciona para Windows, Linux y Mac OSX

Descargar

El estable actual La versión v0.1.2 (3 de julio de 2019) está disponible para descargar. Hay una versión anticipada de QuPath v0.2.0 disponible para pruebas. Descargar QuPath para: Windows, Linux o Mac OSX.

Recursos

Análisis de imágenes de diapositiva completa

Software de análisis y visores de imágenes de diapositivas completas gratuitos y de código abierto

Etiquetas

Patología Imagen de diapositiva completa Java Código abierto Linux Windows macos investigación

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