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FastQC: Herramienta de análisis de control de calidad para datos de secuenciación de alto rendimiento

By admin Jan 29, 2024

FastQC es una herramienta de análisis de control de calidad para conjuntos de datos de secuenciación de alto rendimiento. Comprueba la calidad de los datos de secuencia sin procesar, ejecuta análisis en archivos de secuencia y produce un informe que resalta cualquier área inusual. Puede utilizarse para varios tipos de técnicas de secuenciación.

FastQC resaltará cualquier área donde esta biblioteca parezca inusual y donde debería observar más de cerca.

FastQC no está vinculado a ningún tipo específico de técnica de secuenciación, por lo que se puede utilizar para examinar bibliotecas de varios tipos de experimentos (secuenciación genómica, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq, etc., etc.).

FastQC está escrito en Java, lo que la convierte en una aplicación multiplataforma que puede ejecutarse en sistemas Windows, Linux, macOS y Unix.

Características

  • Importa datos de BAM, SAM, FastQ y otros formatos de archivo compatibles
  • Proporciona una descripción general completa de los datos, identifica áreas problemáticas potenciales y sugiere soluciones.
  • Genera gráficos y tablas de resumen detallados para una evaluación exhaustiva de los datos.
  • Ofrece la opción de exportar resultados a HTML, lo que permite compartir y colaborar fácilmente.
  • Admite el uso sin conexión, lo que garantiza accesibilidad y comodidad incluso sin conexión a Internet

Plataformas

  • ventanas
  • linux
  • Mac OS

Licencia

Licencia pública general GNU versión 3.0 (GPLv3)

Recursos y descarga

Etiquetas

Calidad Control de calidad Código abierto Java Multiplataforma Windows Arch Linux Linux Linux Mint Ubuntu Fedora Debian

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