Como nosotros en MEDevel.com estamos buscando aplicaciones médicas y de atención médica de código abierto, así como educación y desarrollo de software. La química no es una excepción. Así que aquí está nuestra lista de marcos y bibliotecas de química de código abierto.
1- Química Abierta
Química abierta tiene una colección de proyectos específicos de química de código abierto
- Avogadro; una aplicación de escritorio para editar y visualizar datos moleculares
- MoleQueue proporciona integración de escritorio de recursos informáticos de alto rendimiento (HPC), junto con ejecución local de código independiente. Es una pequeña aplicación residente en la bandeja del sistema, basada en Qt, que facilita el acceso a los recursos informáticos desde aplicaciones gráficas.
- Tomviz ofrece una aplicación de escritorio para el procesamiento, visualización y análisis de datos tomográficos 3D.
- Aquí está el Colección abierta de química en GitHub.
2- Moléculas abiertas
Moléculas abiertas contiene algún conjunto de proyectos de código abierto como
- guerrero de datos; un programa de análisis y visualización de datos de código abierto con inteligencia química integrada.
- Osiris Property Explorer fue lanzado originalmente en 2000 por Actelion Pharmaceuticals Ltd.
- Torsion Explorer es una herramienta fácil de usar para aprender sobre las conformaciones de las moléculas.
- www.webreacciones.net. Desde
3- Kit de desarrollo de química
CDK o Chemistry Development Kit es una biblioteca Java modular de código abierto para química-informática.
Características y funcionalidades
- Representación de enlaces de valencia de moléculas y reacciones.
- Leer y escribir formatos de archivos: SMILES, SDF, InChI, Mol2, CML y otros.
- Algoritmos eficientes de procesamiento de moléculas: búsqueda de anillos, kekulización, aromaticidad.
- Generación y renderizado de coordenadas.
- Identificadores canónicos para una búsqueda rápida y exacta.
- Búsqueda de patrones de subestructura y SMARTS.
- ECFP, Daylight, MACCS y otros métodos de huellas dactilares para búsqueda de similitudes.
- Cálculos del descriptor QSAR
4-PSI4
PSI4 es una biblioteca de código abierto para química cuántica que se publica bajo la licencia LGPL3 y está disponible para C++ y Python.
5- Araña química
químicaaraña es una base de datos de estructuras químicas gratuita que proporciona acceso rápido de búsqueda de estructuras y texto a más de 100 millones de estructuras de cientos de fuentes de datos.
6- ChemDoodle
ChemDoodle es una biblioteca JavaScript gratuita de código abierto para interfaces científicas HTML5 rápidas y profesionales.
El Componentes web de ChemDoodle (CWC) la biblioteca es pura javascript Biblioteca de gráficos químicos y quimioinformática derivada de la ChemDoodle® aplicación y producido por iChemLabs.
Componentes web de ChemDoodle permitir al usuario presentar gráficos y animaciones 2D y 3D con calidad de publicación para estructuras químicas, reacciones y espectros.
7- NWChem
NWChem es una química computacional de alto rendimiento gratuita y de código abierto.
NWChem es desarrollado activamente por un consorcio de desarrolladores y mantenido por la EMSL ubicado en el Laboratorio Nacional del Noroeste del Pacífico (PNL) en el estado de Washington. Los investigadores interesados en contribuir a NWChem deben revisar el Página de desarrolladores. El código se distribuye como código abierto según los términos del Licencia Comunitaria Educativa versión 2.0 (ECL 2.0).
El software NWChem puede manejar:
- Biomoléculas, nanoestructuras y estado sólido.
- De lo cuántico a lo clásico y todas sus combinaciones.
- Estados terreno y excitado
- Funciones de base gaussiana u ondas planas
- Escalando de uno a miles de procesadores
- Propiedades y efectos relativistas.
8- Babel abierta
Babel abierta es una caja de herramientas químicas diseñada para hablar los numerosos idiomas de los datos químicos. Es un proyecto colaborativo abierto que permite a cualquiera buscar, convertir, analizar o almacenar datos de modelado molecular, química, materiales de estado sólido, bioquímica o áreas relacionadas.
9- Centroa
Cantera es un conjunto de herramientas de código abierto para problemas relacionados con la cinética química, la termodinámica y los procesos de transporte.
10-PySCF
El marco de simulaciones de química basadas en Python (PySCF) es una colección de código abierto de módulos de estructura electrónica impulsados por Python. El paquete proporciona una plataforma simple, liviana y eficiente para el desarrollo de metodologías y cálculos de química cuántica.
11- Licuadora Química
Blender es un software gratuito de diseño y modelado 3D de código abierto. licuadora química permite a los diseños y a los estudiantes dibujar productos químicos en una licuadora >2,8 utilizando entradas comunes.
El proyecto es de código abierto y se publica bajo la licencia MIT.
12- Webchem
webchem es un paquete R para recuperar información química de la web. Este paquete interactúa con un conjunto de API web para recuperar información química.
13- Termo
Termo es un software de código abierto para ingenieros, científicos, técnicos y cualquiera que intente comprender el universo con más detalle.
Facilita la recuperación de constantes de sustancias químicas, el cálculo de propiedades químicas dependientes de la temperatura y la presión (tanto termodinámicas como de transporte) y el cálculo de las mismas para mezclas químicas (incluido el equilibrio de fases) utilizando varios modelos.
Thermo está escrito en Python y se puede instalar usando Conda o desde la fuente.
14- Fluidos
fluidos La biblioteca es un software de código abierto para ingenieros y técnicos que trabajan en los campos de la ingeniería química, mecánica o civil.
Incluye módulos para tuberías, accesorios,
bombas, tanques, flujo compresible, flujo en canal abierto, propiedades atmosféricas, propiedades solares, distribuciones de tamaño de partículas, flujo de dos fases, factores de fricción, válvulas de control, placas de orificio y otros medidores de flujo, eyectores, válvulas de alivio. válvulas y más.
15- Catalyst.jl
Catalyst.jl es un paquete de modelado simbólico para análisis y simulación de alto rendimiento de redes de reacciones químicas para el lenguaje de programación Julia.
16- QuímicaML
químicaml es un conjunto de programas de informática y aprendizaje automático para el análisis, extracción y modelado de datos químicos y de materiales.
17- Computación Química
Esto es un proyecto de código abierto para exploraciones en informática química con Clojure.
18- QuímicaCSS
El química CSS Biblioteca para crear estructuras y ecuaciones químicas con solo HTML. Proyecto similar a: MatemáticasCSS.
Si conoce algún otro marco o biblioteca de química que no hayamos mencionado aquí, háganoslo saber.
Recursos
Foto de Karolina Grabowska.
Etiquetas
ciencia Marcos de biblioteca de código abierto Química
